Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CLSTN1O94985 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms