Protein–RNA interactions for Protein: O94979

SEC31A, Protein transport protein Sec31A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31AO94979 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEC31AO94979 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC31AO94979 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms