Protein–RNA interactions for Protein: O75976

CPD, Carboxypeptidase D, humanhuman

Predictions only

Length 1,380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPDO75976 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CPDO75976 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CPDO75976 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CPDO75976 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CPDO75976 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CPDO75976 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CPDO75976 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CPDO75976 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CPDO75976 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CPDO75976 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CPDO75976 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CPDO75976 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CPDO75976 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
CPDO75976 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CPDO75976 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CPDO75976 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CPDO75976 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CPDO75976 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CPDO75976 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CPDO75976 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CPDO75976 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CPDO75976 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CPDO75976 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CPDO75976 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CPDO75976 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CPDO75976 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CPDO75976 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CPDO75976 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CPDO75976 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CPDO75976 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CPDO75976 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CPDO75976 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CPDO75976 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CPDO75976 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CPDO75976 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CPDO75976 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CPDO75976 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CPDO75976 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CPDO75976 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CPDO75976 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CPDO75976 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CPDO75976 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CPDO75976 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CPDO75976 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CPDO75976 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CPDO75976 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CPDO75976 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CPDO75976 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CPDO75976 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CPDO75976 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CPDO75976 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CPDO75976 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CPDO75976 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CPDO75976 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CPDO75976 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CPDO75976 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CPDO75976 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CPDO75976 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CPDO75976 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CPDO75976 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CPDO75976 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CPDO75976 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CPDO75976 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CPDO75976 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CPDO75976 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CPDO75976 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CPDO75976 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CPDO75976 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CPDO75976 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CPDO75976 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CPDO75976 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CPDO75976 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CPDO75976 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CPDO75976 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CPDO75976 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CPDO75976 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CPDO75976 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CPDO75976 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CPDO75976 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CPDO75976 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CPDO75976 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CPDO75976 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CPDO75976 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CPDO75976 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CPDO75976 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CPDO75976 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CPDO75976 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CPDO75976 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CPDO75976 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CPDO75976 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CPDO75976 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CPDO75976 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CPDO75976 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CPDO75976 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CPDO75976 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CPDO75976 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CPDO75976 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CPDO75976 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CPDO75976 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CPDO75976 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms