Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
VAMP4O75379 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms