Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIN3BO75182 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SIN3BO75182 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms