Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG13O75143 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG13O75143 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG13O75143 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG13O75143 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG13O75143 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG13O75143 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG13O75143 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG13O75143 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG13O75143 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG13O75143 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG13O75143 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG13O75143 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG13O75143 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG13O75143 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG13O75143 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG13O75143 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG13O75143 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG13O75143 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG13O75143 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG13O75143 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG13O75143 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG13O75143 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG13O75143 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG13O75143 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG13O75143 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG13O75143 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG13O75143 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG13O75143 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG13O75143 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG13O75143 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG13O75143 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG13O75143 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG13O75143 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG13O75143 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG13O75143 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG13O75143 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG13O75143 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG13O75143 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG13O75143 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG13O75143 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG13O75143 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG13O75143 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG13O75143 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG13O75143 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG13O75143 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG13O75143 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG13O75143 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG13O75143 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG13O75143 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG13O75143 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG13O75143 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG13O75143 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG13O75143 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG13O75143 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG13O75143 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG13O75143 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG13O75143 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG13O75143 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG13O75143 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG13O75143 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG13O75143 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG13O75143 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG13O75143 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG13O75143 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG13O75143 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG13O75143 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG13O75143 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG13O75143 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG13O75143 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG13O75143 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG13O75143 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG13O75143 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG13O75143 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG13O75143 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG13O75143 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG13O75143 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG13O75143 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG13O75143 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG13O75143 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG13O75143 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG13O75143 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG13O75143 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG13O75143 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG13O75143 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG13O75143 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG13O75143 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG13O75143 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATG13O75143 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATG13O75143 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ATG13O75143 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ATG13O75143 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATG13O75143 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG13O75143 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG13O75143 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG13O75143 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG13O75143 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG13O75143 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG13O75143 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG13O75143 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms