Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMARCA5O60264 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMARCA5O60264 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms