Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EXTL3O43909 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms