Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ATP9BO43861 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms