Protein–RNA interactions for Protein: O43581

SYT7, Synaptotagmin-7, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT7O43581 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYT7O43581 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYT7O43581 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYT7O43581 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYT7O43581 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYT7O43581 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYT7O43581 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYT7O43581 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYT7O43581 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYT7O43581 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYT7O43581 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYT7O43581 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYT7O43581 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYT7O43581 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYT7O43581 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYT7O43581 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYT7O43581 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYT7O43581 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYT7O43581 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYT7O43581 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT7O43581 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT7O43581 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT7O43581 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT7O43581 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT7O43581 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT7O43581 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT7O43581 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT7O43581 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT7O43581 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT7O43581 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT7O43581 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYT7O43581 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT7O43581 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT7O43581 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT7O43581 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT7O43581 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT7O43581 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT7O43581 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT7O43581 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT7O43581 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT7O43581 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT7O43581 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT7O43581 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT7O43581 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT7O43581 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT7O43581 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT7O43581 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT7O43581 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT7O43581 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT7O43581 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT7O43581 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT7O43581 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT7O43581 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT7O43581 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT7O43581 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT7O43581 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYT7O43581 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT7O43581 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT7O43581 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT7O43581 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT7O43581 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT7O43581 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT7O43581 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT7O43581 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT7O43581 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT7O43581 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT7O43581 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT7O43581 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT7O43581 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT7O43581 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT7O43581 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT7O43581 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT7O43581 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT7O43581 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT7O43581 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT7O43581 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT7O43581 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT7O43581 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT7O43581 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT7O43581 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT7O43581 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYT7O43581 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT7O43581 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT7O43581 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT7O43581 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT7O43581 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT7O43581 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT7O43581 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT7O43581 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT7O43581 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT7O43581 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT7O43581 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT7O43581 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT7O43581 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT7O43581 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT7O43581 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT7O43581 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT7O43581 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT7O43581 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYT7O43581 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms