Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTIFO43310 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTIFO43310 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CTIFO43310 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTIFO43310 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTIFO43310 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTIFO43310 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTIFO43310 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTIFO43310 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTIFO43310 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTIFO43310 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTIFO43310 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTIFO43310 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTIFO43310 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTIFO43310 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTIFO43310 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTIFO43310 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTIFO43310 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTIFO43310 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTIFO43310 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTIFO43310 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTIFO43310 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CTIFO43310 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTIFO43310 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTIFO43310 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTIFO43310 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTIFO43310 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTIFO43310 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTIFO43310 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTIFO43310 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTIFO43310 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTIFO43310 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTIFO43310 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTIFO43310 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTIFO43310 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CTIFO43310 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTIFO43310 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTIFO43310 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTIFO43310 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTIFO43310 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTIFO43310 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTIFO43310 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTIFO43310 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTIFO43310 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTIFO43310 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTIFO43310 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTIFO43310 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTIFO43310 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTIFO43310 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTIFO43310 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTIFO43310 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTIFO43310 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTIFO43310 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTIFO43310 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CTIFO43310 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTIFO43310 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTIFO43310 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTIFO43310 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTIFO43310 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTIFO43310 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CTIFO43310 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTIFO43310 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTIFO43310 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTIFO43310 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTIFO43310 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTIFO43310 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTIFO43310 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTIFO43310 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTIFO43310 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTIFO43310 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CTIFO43310 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTIFO43310 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CTIFO43310 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTIFO43310 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTIFO43310 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTIFO43310 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTIFO43310 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTIFO43310 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTIFO43310 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTIFO43310 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTIFO43310 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTIFO43310 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTIFO43310 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTIFO43310 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTIFO43310 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTIFO43310 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTIFO43310 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTIFO43310 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTIFO43310 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTIFO43310 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTIFO43310 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTIFO43310 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTIFO43310 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTIFO43310 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTIFO43310 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTIFO43310 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTIFO43310 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CTIFO43310 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTIFO43310 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTIFO43310 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
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