Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
APAF1O14727 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
APAF1O14727 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
APAF1O14727 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
APAF1O14727 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
APAF1O14727 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
APAF1O14727 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
APAF1O14727 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
APAF1O14727 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
APAF1O14727 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
APAF1O14727 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
APAF1O14727 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
APAF1O14727 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
APAF1O14727 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
APAF1O14727 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
APAF1O14727 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
APAF1O14727 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
APAF1O14727 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
APAF1O14727 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
APAF1O14727 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
APAF1O14727 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
APAF1O14727 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
APAF1O14727 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
APAF1O14727 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
APAF1O14727 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
APAF1O14727 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
APAF1O14727 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
APAF1O14727 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
APAF1O14727 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
APAF1O14727 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
APAF1O14727 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
APAF1O14727 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
APAF1O14727 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
APAF1O14727 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
APAF1O14727 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
APAF1O14727 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
APAF1O14727 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
APAF1O14727 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
APAF1O14727 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
APAF1O14727 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
APAF1O14727 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
APAF1O14727 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
APAF1O14727 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
APAF1O14727 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
APAF1O14727 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
APAF1O14727 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
APAF1O14727 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
APAF1O14727 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
APAF1O14727 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
APAF1O14727 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
APAF1O14727 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
APAF1O14727 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
APAF1O14727 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
APAF1O14727 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
APAF1O14727 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
APAF1O14727 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
APAF1O14727 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
APAF1O14727 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
APAF1O14727 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
APAF1O14727 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
APAF1O14727 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
APAF1O14727 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
APAF1O14727 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
APAF1O14727 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
APAF1O14727 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
APAF1O14727 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
APAF1O14727 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
APAF1O14727 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
APAF1O14727 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
APAF1O14727 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
APAF1O14727 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
APAF1O14727 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
APAF1O14727 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
APAF1O14727 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
APAF1O14727 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
APAF1O14727 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
APAF1O14727 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
APAF1O14727 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
APAF1O14727 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
APAF1O14727 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
APAF1O14727 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
APAF1O14727 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
APAF1O14727 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
APAF1O14727 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
APAF1O14727 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
APAF1O14727 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
APAF1O14727 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
APAF1O14727 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
APAF1O14727 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
APAF1O14727 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
APAF1O14727 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
APAF1O14727 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
APAF1O14727 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
APAF1O14727 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
APAF1O14727 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
APAF1O14727 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
APAF1O14727 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
APAF1O14727 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
APAF1O14727 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
APAF1O14727 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms