Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PTPRTO14522 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PTPRTO14522 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PTPRTO14522 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC30.95■■■□□ 2.54
PTPRTO14522 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
PTPRTO14522 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
PTPRTO14522 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
PTPRTO14522 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PTPRTO14522 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
PTPRTO14522 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
PTPRTO14522 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTPRTO14522 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTPRTO14522 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTPRTO14522 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTPRTO14522 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRTO14522 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRTO14522 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRTO14522 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRTO14522 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRTO14522 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRTO14522 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRTO14522 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRTO14522 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRTO14522 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRTO14522 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRTO14522 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRTO14522 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRTO14522 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRTO14522 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRTO14522 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRTO14522 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRTO14522 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRTO14522 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRTO14522 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRTO14522 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRTO14522 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPRTO14522 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPRTO14522 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPRTO14522 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPRTO14522 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPRTO14522 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPRTO14522 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPRTO14522 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPRTO14522 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTPRTO14522 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
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