Protein–RNA interactions for Protein: O00522

KRIT1, Krev interaction trapped protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRIT1O00522 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRIT1O00522 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRIT1O00522 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRIT1O00522 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRIT1O00522 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRIT1O00522 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRIT1O00522 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRIT1O00522 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRIT1O00522 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRIT1O00522 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRIT1O00522 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRIT1O00522 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRIT1O00522 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRIT1O00522 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KRIT1O00522 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KRIT1O00522 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRIT1O00522 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KRIT1O00522 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRIT1O00522 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRIT1O00522 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRIT1O00522 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRIT1O00522 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRIT1O00522 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRIT1O00522 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRIT1O00522 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRIT1O00522 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRIT1O00522 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRIT1O00522 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRIT1O00522 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRIT1O00522 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRIT1O00522 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRIT1O00522 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRIT1O00522 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRIT1O00522 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRIT1O00522 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRIT1O00522 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRIT1O00522 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRIT1O00522 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRIT1O00522 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRIT1O00522 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRIT1O00522 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRIT1O00522 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRIT1O00522 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRIT1O00522 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRIT1O00522 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRIT1O00522 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRIT1O00522 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KRIT1O00522 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRIT1O00522 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRIT1O00522 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRIT1O00522 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRIT1O00522 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
KRIT1O00522 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
KRIT1O00522 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRIT1O00522 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms