Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
O00370 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
O00370 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
O00370 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
O00370 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
O00370 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
O00370 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
O00370 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
O00370 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
O00370 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
O00370 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
O00370 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
O00370 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
O00370 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
O00370 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
O00370 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
O00370 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
O00370 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
O00370 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
O00370 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
O00370 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
O00370 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
O00370 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
O00370 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
O00370 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
O00370 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
O00370 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
O00370 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
O00370 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
O00370 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
O00370 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
O00370 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
O00370 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
O00370 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
O00370 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
O00370 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
O00370 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
O00370 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
O00370 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
O00370 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
O00370 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
O00370 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
O00370 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
O00370 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
O00370 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
O00370 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
O00370 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
O00370 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
O00370 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
O00370 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
O00370 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
O00370 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
O00370 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
O00370 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
O00370 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
O00370 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
O00370 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
O00370 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
O00370 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
O00370 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
O00370 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
O00370 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
O00370 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
O00370 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
O00370 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
O00370 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
O00370 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
O00370 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
O00370 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
O00370 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
O00370 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
O00370 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
O00370 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
O00370 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
O00370 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
O00370 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
O00370 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
O00370 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
O00370 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
O00370 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
O00370 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
O00370 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
O00370 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
O00370 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
O00370 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
O00370 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
O00370 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
O00370 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
O00370 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
O00370 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
O00370 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
O00370 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
O00370 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
O00370 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
O00370 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
O00370 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
O00370 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
O00370 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
O00370 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
O00370 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms