Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PIK3CDO00329 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PIK3CDO00329 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3CDO00329 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms