Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TULP1O00294 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TULP1O00294 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TULP1O00294 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TULP1O00294 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TULP1O00294 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TULP1O00294 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TULP1O00294 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TULP1O00294 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TULP1O00294 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TULP1O00294 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TULP1O00294 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TULP1O00294 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TULP1O00294 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TULP1O00294 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TULP1O00294 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TULP1O00294 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TULP1O00294 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TULP1O00294 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TULP1O00294 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TULP1O00294 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TULP1O00294 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TULP1O00294 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TULP1O00294 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TULP1O00294 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TULP1O00294 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TULP1O00294 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TULP1O00294 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TULP1O00294 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TULP1O00294 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TULP1O00294 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TULP1O00294 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TULP1O00294 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TULP1O00294 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TULP1O00294 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TULP1O00294 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TULP1O00294 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TULP1O00294 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TULP1O00294 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TULP1O00294 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TULP1O00294 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TULP1O00294 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TULP1O00294 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TULP1O00294 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TULP1O00294 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TULP1O00294 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TULP1O00294 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TULP1O00294 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TULP1O00294 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TULP1O00294 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TULP1O00294 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TULP1O00294 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TULP1O00294 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TULP1O00294 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TULP1O00294 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TULP1O00294 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TULP1O00294 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TULP1O00294 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TULP1O00294 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TULP1O00294 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TULP1O00294 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TULP1O00294 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TULP1O00294 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TULP1O00294 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TULP1O00294 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TULP1O00294 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TULP1O00294 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TULP1O00294 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TULP1O00294 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TULP1O00294 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TULP1O00294 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TULP1O00294 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TULP1O00294 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TULP1O00294 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TULP1O00294 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TULP1O00294 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TULP1O00294 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TULP1O00294 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TULP1O00294 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TULP1O00294 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TULP1O00294 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TULP1O00294 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TULP1O00294 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TULP1O00294 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TULP1O00294 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TULP1O00294 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TULP1O00294 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TULP1O00294 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TULP1O00294 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TULP1O00294 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TULP1O00294 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TULP1O00294 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TULP1O00294 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TULP1O00294 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TULP1O00294 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TULP1O00294 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TULP1O00294 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TULP1O00294 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TULP1O00294 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TULP1O00294 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms