Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2K7ER74 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms