Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E9PBE3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E9PBE3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E9PBE3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E9PBE3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E9PBE3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E9PBE3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E9PBE3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E9PBE3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E9PBE3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E9PBE3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
E9PBE3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
E9PBE3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E9PBE3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E9PBE3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E9PBE3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E9PBE3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E9PBE3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E9PBE3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E9PBE3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E9PBE3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E9PBE3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E9PBE3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
E9PBE3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E9PBE3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E9PBE3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E9PBE3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
E9PBE3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
E9PBE3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E9PBE3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
E9PBE3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E9PBE3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E9PBE3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E9PBE3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E9PBE3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E9PBE3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E9PBE3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E9PBE3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E9PBE3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E9PBE3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E9PBE3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E9PBE3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E9PBE3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E9PBE3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E9PBE3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E9PBE3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E9PBE3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E9PBE3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E9PBE3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
E9PBE3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
E9PBE3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E9PBE3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E9PBE3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E9PBE3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E9PBE3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E9PBE3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E9PBE3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
E9PBE3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E9PBE3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E9PBE3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E9PBE3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E9PBE3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E9PBE3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E9PBE3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E9PBE3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E9PBE3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
E9PBE3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
E9PBE3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
E9PBE3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
E9PBE3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
E9PBE3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E9PBE3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E9PBE3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E9PBE3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E9PBE3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E9PBE3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
E9PBE3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E9PBE3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E9PBE3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
E9PBE3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E9PBE3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E9PBE3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E9PBE3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E9PBE3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E9PBE3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E9PBE3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E9PBE3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E9PBE3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E9PBE3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E9PBE3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E9PBE3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E9PBE3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E9PBE3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
E9PBE3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
E9PBE3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E9PBE3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E9PBE3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
E9PBE3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E9PBE3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E9PBE3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms