Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPBD1B2RD01 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CENPBD1B2RD01 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms