Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF3BA8MYP8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF3BA8MYP8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms