Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYSRT1A8MQ03 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CYSRT1A8MQ03 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms