Protein–RNA interactions for Protein: A6XGL0

YJEFN3, YjeF N-terminal domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YJEFN3A6XGL0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YJEFN3A6XGL0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YJEFN3A6XGL0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms