Protein–RNA interactions for Protein: A6NK53

ZNF233, Zinc finger protein 233, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF233A6NK53 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ZNF233A6NK53 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF233A6NK53 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF233A6NK53 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF233A6NK53 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF233A6NK53 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF233A6NK53 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF233A6NK53 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF233A6NK53 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF233A6NK53 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF233A6NK53 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF233A6NK53 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF233A6NK53 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF233A6NK53 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF233A6NK53 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF233A6NK53 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms