Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NEMP2A6NFY4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEMP2A6NFY4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms