Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6BA6NDN3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms