Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6CA6NDK9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms