Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
LAMB4A4D0S4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LAMB4A4D0S4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LAMB4A4D0S4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LAMB4A4D0S4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
LAMB4A4D0S4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LAMB4A4D0S4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LAMB4A4D0S4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LAMB4A4D0S4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LAMB4A4D0S4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms