Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VWA8A3KMH1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VWA8A3KMH1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms