Protein–RNA interactions for Protein: U3KQK5

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQK5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQK5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQK5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQK5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQK5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQK5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQK5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQK5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQK5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
U3KQK5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
U3KQK5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
U3KQK5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
U3KQK5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
U3KQK5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
U3KQK5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
U3KQK5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
U3KQK5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
U3KQK5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
U3KQK5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
U3KQK5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
U3KQK5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
U3KQK5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
U3KQK5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
U3KQK5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
U3KQK5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
U3KQK5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
U3KQK5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
U3KQK5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
U3KQK5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
U3KQK5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
U3KQK5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
U3KQK5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
U3KQK5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
U3KQK5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
U3KQK5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
U3KQK5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
U3KQK5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
U3KQK5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
U3KQK5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
U3KQK5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
U3KQK5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
U3KQK5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
U3KQK5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
U3KQK5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
U3KQK5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
U3KQK5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
U3KQK5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
U3KQK5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
U3KQK5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
U3KQK5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
U3KQK5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
U3KQK5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
U3KQK5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
U3KQK5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
U3KQK5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
U3KQK5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
U3KQK5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
U3KQK5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
U3KQK5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
U3KQK5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
U3KQK5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
U3KQK5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
U3KQK5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
U3KQK5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
U3KQK5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
U3KQK5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQK5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQK5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQK5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQK5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQK5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQK5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQK5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQK5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQK5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQK5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQK5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQK5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQK5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQK5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQK5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQK5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQK5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQK5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQK5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQK5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQK5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
U3KQK5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQK5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQK5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQK5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQK5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQK5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQK5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQK5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQK5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQK5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQK5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQK5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
U3KQK5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms