Protein–RNA interactions for Protein: R4GMQ9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R4GMQ9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
R4GMQ9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
R4GMQ9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
R4GMQ9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
R4GMQ9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
R4GMQ9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
R4GMQ9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
R4GMQ9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
R4GMQ9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
R4GMQ9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
R4GMQ9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
R4GMQ9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
R4GMQ9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
R4GMQ9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
R4GMQ9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
R4GMQ9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
R4GMQ9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
R4GMQ9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
R4GMQ9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
R4GMQ9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
R4GMQ9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
R4GMQ9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
R4GMQ9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
R4GMQ9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
R4GMQ9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
R4GMQ9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
R4GMQ9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
R4GMQ9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
R4GMQ9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
R4GMQ9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
R4GMQ9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
R4GMQ9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
R4GMQ9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
R4GMQ9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
R4GMQ9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
R4GMQ9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
R4GMQ9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
R4GMQ9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
R4GMQ9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
R4GMQ9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
R4GMQ9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
R4GMQ9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
R4GMQ9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
R4GMQ9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
R4GMQ9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
R4GMQ9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
R4GMQ9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
R4GMQ9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
R4GMQ9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
R4GMQ9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
R4GMQ9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
R4GMQ9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
R4GMQ9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
R4GMQ9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
R4GMQ9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
R4GMQ9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
R4GMQ9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
R4GMQ9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
R4GMQ9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
R4GMQ9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
R4GMQ9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
R4GMQ9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
R4GMQ9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
R4GMQ9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
R4GMQ9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
R4GMQ9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
R4GMQ9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
R4GMQ9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
R4GMQ9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
R4GMQ9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
R4GMQ9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
R4GMQ9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
R4GMQ9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
R4GMQ9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
R4GMQ9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
R4GMQ9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
R4GMQ9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
R4GMQ9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
R4GMQ9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
R4GMQ9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
R4GMQ9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
R4GMQ9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
R4GMQ9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
R4GMQ9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
R4GMQ9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
R4GMQ9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
R4GMQ9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
R4GMQ9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
R4GMQ9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
R4GMQ9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
R4GMQ9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
R4GMQ9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
R4GMQ9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
R4GMQ9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
R4GMQ9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
R4GMQ9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
R4GMQ9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
R4GMQ9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
R4GMQ9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
R4GMQ9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms