Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC61Q9Y6R9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms