Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LINC00312Q9Y6C7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00312Q9Y6C7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms