Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C2

EMILIN1, EMILIN-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,016 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN1Q9Y6C2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EMILIN1Q9Y6C2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
EMILIN1Q9Y6C2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EMILIN1Q9Y6C2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
EMILIN1Q9Y6C2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EMILIN1Q9Y6C2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EMILIN1Q9Y6C2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
EMILIN1Q9Y6C2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EMILIN1Q9Y6C2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EMILIN1Q9Y6C2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EMILIN1Q9Y6C2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms