Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E4

PCDHB5, Protocadherin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB5Q9Y5E4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PCDHB5Q9Y5E4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB5Q9Y5E4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB5Q9Y5E4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB5Q9Y5E4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB5Q9Y5E4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB5Q9Y5E4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB5Q9Y5E4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB5Q9Y5E4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB5Q9Y5E4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB5Q9Y5E4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB5Q9Y5E4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB5Q9Y5E4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB5Q9Y5E4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB5Q9Y5E4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB5Q9Y5E4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB5Q9Y5E4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB5Q9Y5E4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB5Q9Y5E4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB5Q9Y5E4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB5Q9Y5E4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms