Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E3

PCDHB6, Protocadherin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB6Q9Y5E3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHB6Q9Y5E3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms