Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9Y3F1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9Y3F1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms