Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A4

RRP7A, Ribosomal RNA-processing protein 7 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7AQ9Y3A4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RRP7AQ9Y3A4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RRP7AQ9Y3A4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RRP7AQ9Y3A4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RRP7AQ9Y3A4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RRP7AQ9Y3A4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RRP7AQ9Y3A4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RRP7AQ9Y3A4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RRP7AQ9Y3A4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RRP7AQ9Y3A4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RRP7AQ9Y3A4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RRP7AQ9Y3A4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RRP7AQ9Y3A4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RRP7AQ9Y3A4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RRP7AQ9Y3A4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RRP7AQ9Y3A4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RRP7AQ9Y3A4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RRP7AQ9Y3A4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RRP7AQ9Y3A4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RRP7AQ9Y3A4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RRP7AQ9Y3A4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RRP7AQ9Y3A4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RRP7AQ9Y3A4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RRP7AQ9Y3A4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RRP7AQ9Y3A4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RRP7AQ9Y3A4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RRP7AQ9Y3A4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RRP7AQ9Y3A4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RRP7AQ9Y3A4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RRP7AQ9Y3A4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RRP7AQ9Y3A4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RRP7AQ9Y3A4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RRP7AQ9Y3A4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RRP7AQ9Y3A4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RRP7AQ9Y3A4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RRP7AQ9Y3A4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RRP7AQ9Y3A4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RRP7AQ9Y3A4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RRP7AQ9Y3A4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RRP7AQ9Y3A4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RRP7AQ9Y3A4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RRP7AQ9Y3A4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RRP7AQ9Y3A4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RRP7AQ9Y3A4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RRP7AQ9Y3A4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms