Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
KDM2AQ9Y2K7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
KDM2AQ9Y2K7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
KDM2AQ9Y2K7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
KDM2AQ9Y2K7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
KDM2AQ9Y2K7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
KDM2AQ9Y2K7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
KDM2AQ9Y2K7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
KDM2AQ9Y2K7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
KDM2AQ9Y2K7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
KDM2AQ9Y2K7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
KDM2AQ9Y2K7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
KDM2AQ9Y2K7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
KDM2AQ9Y2K7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
KDM2AQ9Y2K7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
KDM2AQ9Y2K7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
KDM2AQ9Y2K7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
KDM2AQ9Y2K7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
KDM2AQ9Y2K7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
KDM2AQ9Y2K7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
KDM2AQ9Y2K7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
KDM2AQ9Y2K7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
KDM2AQ9Y2K7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
KDM2AQ9Y2K7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
KDM2AQ9Y2K7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
KDM2AQ9Y2K7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
KDM2AQ9Y2K7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
KDM2AQ9Y2K7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
KDM2AQ9Y2K7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
KDM2AQ9Y2K7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
KDM2AQ9Y2K7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
KDM2AQ9Y2K7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
KDM2AQ9Y2K7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
KDM2AQ9Y2K7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
KDM2AQ9Y2K7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
KDM2AQ9Y2K7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
KDM2AQ9Y2K7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
KDM2AQ9Y2K7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
KDM2AQ9Y2K7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
KDM2AQ9Y2K7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
KDM2AQ9Y2K7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
KDM2AQ9Y2K7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
KDM2AQ9Y2K7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
KDM2AQ9Y2K7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC30.17■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KDM2AQ9Y2K7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms