Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.28
SBNO2Q9Y2G9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SBNO2Q9Y2G9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SBNO2Q9Y2G9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SBNO2Q9Y2G9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SBNO2Q9Y2G9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SBNO2Q9Y2G9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SBNO2Q9Y2G9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SBNO2Q9Y2G9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SBNO2Q9Y2G9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SBNO2Q9Y2G9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SBNO2Q9Y2G9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SBNO2Q9Y2G9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SBNO2Q9Y2G9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SBNO2Q9Y2G9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SBNO2Q9Y2G9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SBNO2Q9Y2G9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SBNO2Q9Y2G9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SBNO2Q9Y2G9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SBNO2Q9Y2G9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SBNO2Q9Y2G9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SBNO2Q9Y2G9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SBNO2Q9Y2G9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SBNO2Q9Y2G9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SBNO2Q9Y2G9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SBNO2Q9Y2G9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SBNO2Q9Y2G9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SBNO2Q9Y2G9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SBNO2Q9Y2G9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SBNO2Q9Y2G9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SBNO2Q9Y2G9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SBNO2Q9Y2G9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SBNO2Q9Y2G9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SBNO2Q9Y2G9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SBNO2Q9Y2G9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SBNO2Q9Y2G9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SBNO2Q9Y2G9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SBNO2Q9Y2G9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SBNO2Q9Y2G9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SBNO2Q9Y2G9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SBNO2Q9Y2G9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SBNO2Q9Y2G9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SBNO2Q9Y2G9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SBNO2Q9Y2G9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SBNO2Q9Y2G9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SBNO2Q9Y2G9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SBNO2Q9Y2G9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SBNO2Q9Y2G9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SBNO2Q9Y2G9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SBNO2Q9Y2G9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SBNO2Q9Y2G9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms