Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DTX4Q9Y2E6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DTX4Q9Y2E6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DTX4Q9Y2E6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DTX4Q9Y2E6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DTX4Q9Y2E6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DTX4Q9Y2E6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DTX4Q9Y2E6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DTX4Q9Y2E6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DTX4Q9Y2E6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DTX4Q9Y2E6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DTX4Q9Y2E6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DTX4Q9Y2E6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DTX4Q9Y2E6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DTX4Q9Y2E6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DTX4Q9Y2E6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DTX4Q9Y2E6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DTX4Q9Y2E6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DTX4Q9Y2E6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DTX4Q9Y2E6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DTX4Q9Y2E6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DTX4Q9Y2E6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DTX4Q9Y2E6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DTX4Q9Y2E6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DTX4Q9Y2E6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DTX4Q9Y2E6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DTX4Q9Y2E6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DTX4Q9Y2E6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DTX4Q9Y2E6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DTX4Q9Y2E6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DTX4Q9Y2E6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DTX4Q9Y2E6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DTX4Q9Y2E6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
DTX4Q9Y2E6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms