Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y240

CLEC11A, C-type lectin domain family 11 member A, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC11AQ9Y240 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLEC11AQ9Y240 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLEC11AQ9Y240 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLEC11AQ9Y240 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CLEC11AQ9Y240 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLEC11AQ9Y240 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CLEC11AQ9Y240 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLEC11AQ9Y240 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CLEC11AQ9Y240 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLEC11AQ9Y240 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLEC11AQ9Y240 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CLEC11AQ9Y240 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLEC11AQ9Y240 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLEC11AQ9Y240 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLEC11AQ9Y240 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLEC11AQ9Y240 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLEC11AQ9Y240 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLEC11AQ9Y240 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLEC11AQ9Y240 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CLEC11AQ9Y240 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLEC11AQ9Y240 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLEC11AQ9Y240 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLEC11AQ9Y240 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLEC11AQ9Y240 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms