Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SMC3Q9UQE7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMC3Q9UQE7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms