Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
AGTPBP1Q9UPW5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGTPBP1Q9UPW5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms