Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SCAF8Q9UPN6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCAF8Q9UPN6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAF8Q9UPN6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms