Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTF2Q9UNY4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms