Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN73

PCDHA6, Protocadherin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA6Q9UN73 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHA6Q9UN73 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA6Q9UN73 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA6Q9UN73 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA6Q9UN73 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA6Q9UN73 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA6Q9UN73 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA6Q9UN73 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA6Q9UN73 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA6Q9UN73 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA6Q9UN73 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA6Q9UN73 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA6Q9UN73 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA6Q9UN73 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA6Q9UN73 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA6Q9UN73 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA6Q9UN73 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA6Q9UN73 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA6Q9UN73 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA6Q9UN73 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA6Q9UN73 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA6Q9UN73 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA6Q9UN73 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA6Q9UN73 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCDHA6Q9UN73 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCDHA6Q9UN73 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCDHA6Q9UN73 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA6Q9UN73 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms