Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MED23Q9ULK4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MED23Q9ULK4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MED23Q9ULK4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MED23Q9ULK4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MED23Q9ULK4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MED23Q9ULK4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MED23Q9ULK4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms