Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PALD1Q9ULE6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PALD1Q9ULE6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PALD1Q9ULE6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PALD1Q9ULE6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PALD1Q9ULE6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PALD1Q9ULE6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PALD1Q9ULE6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PALD1Q9ULE6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PALD1Q9ULE6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PALD1Q9ULE6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PALD1Q9ULE6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PALD1Q9ULE6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PALD1Q9ULE6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PALD1Q9ULE6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PALD1Q9ULE6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PALD1Q9ULE6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PALD1Q9ULE6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PALD1Q9ULE6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PALD1Q9ULE6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PALD1Q9ULE6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PALD1Q9ULE6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PALD1Q9ULE6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PALD1Q9ULE6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PALD1Q9ULE6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PALD1Q9ULE6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PALD1Q9ULE6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PALD1Q9ULE6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PALD1Q9ULE6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PALD1Q9ULE6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PALD1Q9ULE6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PALD1Q9ULE6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PALD1Q9ULE6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PALD1Q9ULE6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PALD1Q9ULE6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PALD1Q9ULE6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PALD1Q9ULE6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PALD1Q9ULE6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PALD1Q9ULE6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PALD1Q9ULE6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PALD1Q9ULE6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PALD1Q9ULE6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PALD1Q9ULE6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms