Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CPA4Q9UI42 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPA4Q9UI42 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms